Мезотерапия строится на локальном введении препаратов в кожу с двумя основными задачами: компенсировать эндогенный дефицит тех или иных компонентов и стимулировать синтетическую активность клеток. Именно поэтому методика занимает место в протоколах коррекции возрастных изменений: при выраженной деградации разных слоёв кожи её сочетают с более глубокими пилингами и аппаратными методиками, оказывающими стимулирующее, детоксикационное и лимфодренажное действие, а для нивелирования сформировавшихся морщин и складок дополняют контурной пластикой.
Ключевой практический вопрос методики — выбор препарата и состава коктейля: обсуждаются химическая природа компонентов, их взаимодействие внутри мезотерапевтических «коктейлей», совместимость активных ингредиентов, а также аргументы за применение готовых коктейлей вместо смешивания ex tempore. Отдельная тема профессиональных дискуссий — биосовместимость вводимых препаратов как причина осложнений, что делает знание фармакологических свойств компонентов обязательным условием безопасного применения.
Помимо эстетических показаний методика используется в лечении дерматозов: описан опыт терапии акне иммуномодулирующими мезотерапевтическими препаратами с оценкой такого подхода как клинически эффективного и перспективного. В хирургической практике мезотерапия входит в оптимизированную тактику ведения пациента — на этапе местной предоперационной подготовки в зоне будущего вмешательства, в ходе самой операции и в послеоперационном периоде наряду с перевязками и компрессионным бельём.
В программе профессиональных мероприятий мезотерапия рассматривается в одном ряду с пилингами, ботулинотерапией, контурной пластикой лица и тела, эпиляцией и коррекцией рубцов — с разбором показаний и противопоказаний, преимуществ и недостатков, рисков, осложнений и отдалённых результатов. Практикуется и сочетание в одном протоколе мезотерапии с кислотным пилингом, что остаётся предметом обсуждения, хотя в европейской практике встречается нередко.